李辰

个人信息

中国科学院上海生命科学研究院生化细胞所，副研究员。主要个人荣誉：赛诺菲—中国科学院上海生命科学研究院优秀青年人才奖励基金。入选浦东新区科学技术专家库。

教育及工作经历

2001年9月-2006年9月 中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所 理学博士

2006年10月-2008年9月 中国科学院上海生命科学研究院 助理研究员

2008年10月至今 中国科学院上海生命科学研究院 副研究员

科研方向

定量蛋白质组学、修饰蛋白质组学方法的建立和发展及其在癌症和信号转导途径研究的应用；转基因小鼠模型肝癌发病机制的蛋白质组动态研究和Wnt信号转导途径/网络的动态研究；蛋白质基因组学。

主要论著

  1. Sheng Q#, Li R#, Dai J#, Li Q, Su Z, Guo Y, Li C, Shyr Y*, Zeng R*. Preprocessing Significantly Improves the Peptide/Protein Identification Sensitivity of High-resolution Isobarically Labeled Tandem Mass Spectrometry Data. Molecular & Cellular Proteomics. 2015; 14(2):405-417.
  2. Fei C, Li Z, Li C, Chen Y, Chen Z, He X, Mao L, Wang X, Zeng R, Li L.Smurf1-mediated Lys29-linked Non-proteolytic Poly-ubiquitination of Axin Negatively Regulates Wnt/β-catenin Signaling. Mol Cell Biol. 2013, 33(20):4095-105.
  3. Wang S, Yin J, Chen D, Nie F, Song X, Fei C, Miao H, Jing C, Ma W, Wang L, Xie S, Li C, Zeng R, Pan W, Hao X, Li L. Small-molecule modulation of Wnt signaling via modulating the Axin-LRP5/6 interaction. Nat Chem Biol. 2013 Sep;9(9):579-85.
  4. Li C#, Ruan HQ#, Liu YS#, Xu MJ, Dai J, Sheng QH, Tan YX, Yao ZZ, Wang HY, Wu JR, Zeng R*. Quantitative proteomics reveal up-regulated protein expression of the SET complex associated with hepatocellular carcinoma. J Proteome Res. 2012 Feb 3;11(2):871-85.
  5. Wu C#, Wei W#, Li C, Li Q, Sheng Q, Zeng R. J Proteome Res. Delicate analysis of post-translational modifications on Dishevelled 3. 2012 Jul 6;11(7):3829-37.
  6. Liu YS#, Luo XY#, Li QR, Li H, Li C, Ni H, Li RX, Wang R, Hu HC, Pan YJ, Chen HQ, Zeng R. Shotgun and targeted proteomics reveal that pre-surgery serum levels of LRG1, SAA, and C4BP may refine prognosis of resected squamous cell lung cancer. J Mol Cell Biol. 2012 Oct;4(5):344-7.
  7. Micutkova L, Diener T, Li C, Rogowska-Wrzesinska A, Mueck C, Huetter E, Weinberger B, Grubeck-Loebenstein B, Roepstorff P, Zeng R, Jansen-Duerr P. Insulin-like growth factor binding protein-6 delays replicative senescence of human fibroblasts. Mech Ageing Dev. 2011 Oct;132(10):468-79.
  8. Sun B, Guo S, Tang Q, Li C, Zeng R, Xiong Z, Zhong C, Ding J. Regulation of the histone acetyltransferase activity of hMOF via autoacetylation of Lys274. Cell Res. 2011 Aug;21(8):1262-6.
  9. Liu Y#, Li C#, Xing Z, Yuan X, Wu Y, Xu M, Tu K, Li Q, Wu C, Zhao M, Zeng R. Proteomic mining in the dysplastic liver of WHV/c-myc mice--insights and indicators for early hepatocarcinogenesis. FEBS J. 2010 Oct;277(19):4039-53.
  10. Li C, Yi-Hong, Tan YX, Ai JH, Zhou H, Li SJ, Zhang L, Xia QC, Wu JR, Wang HY, Zeng R. Analysis of microdissected cells by two-dimensional LC-MS approaches. Methods Mol Biol. 2008;428:193-208.
  11. Ding Y, Xi Y, Chen T, Wang JY, Tao DL, Wu ZL, Li YP, Li C, Zeng R, Li L. Caprin-2 enhances canonical Wnt signaling through regulating LRP5/6 phosphorylation. J Cell Biol. 2008 Sep 8;182(5):865-72.
  12. Li C#, Tan YX#, Zhou H, Ding SJ, Li SJ, Ma DJ, Man XB, Hong Y, Zhang L, Li L, Xia QC, Wu JR, Wang HY, Zeng R. Proteomic analysis of hepatitis B virus-associated hepatocellular carcinoma: Identification of potential tumor markers. Proteomics. 2005 Mar;5(4):1125-39.
  13. Li C, Hong Y, Tan YX, Zhou H, Ai JH, Li SJ, Zhang L, Xia QC, Wu JR, Wang HY, Zeng R, Accurate qualitative and quantitative proteomic analysis of clinical hepatocellular carcinoma using laser capture microdissection coupled with isotope-coded affinity tag and two-dimensional liquid chromatography mass spectrometry. Mol Cell Proteomics. 2004 Apr;3(4):399-409.
  14. 屠成剑, 李辰, 第十三章, 样品的全息制备; 丁士健, 唐柳娅, 李辰, 第二十三章, 蛋白质组学在各领域中的应用; 曾嵘、夏其昌主编, 《蛋白质化学与蛋白质组学》, 1 ed. 北京: 科学出版社, 2004

授权专利

  1. ZL200510029160.X 一种己酮糖(磷酸)激酶的应用，发明人：曾嵘, 袁新雨, 李辰, 周晓
  2. ZL200510029165.2 一种26S蛋白酶体调节亚基1(非ATP酶)的应用，发明人：曾嵘, 袁新雨, 李辰, 周晓
  3. ZL200510029155.9 一种CD59糖蛋白的应用，发明人：曾嵘, 李辰, 周晓, 袁新雨
  4. ZL200510029158.2 一种FK506结合蛋白4的应用，发明人：曾嵘, 李辰, 周晓, 袁新雨
  5. ZL200510029167.1 一种硫氧还蛋白样蛋白2的应用，发明人：曾嵘, 袁新雨, 李辰, 周晓
  6. ZL200610115883.6 一种星形胶质细胞磷酸化蛋白PEA-15的应用，发明人：曾嵘, 周晓, 李辰, 袁新雨
  7. 200610115885.5 一种端粒酶结合蛋白p23的应用，发明人：曾嵘, 周晓, 李辰, 袁新雨
  8. ZL200610115888.9 一种表面脂肪酸结合蛋白E-FABP的应用，发明人：曾嵘, 周晓, 李辰, 袁新雨
  9. ZL200410025465.9 肝细胞癌相关的蛋白质分子标记原癌蛋白18的筛选及其应用，发明人：曾嵘, 王红阳, 夏其昌, 李辰, 谈冶雄
  10. ZL200410025464.4 肝细胞癌相关的蛋白质分子标记异种核糖核蛋白K的筛选及其应用，发明人：曾嵘, 王红阳, 夏其昌, 李辰, 谈冶雄
  11. ZL200910056784.9 一种细胞周期检查点调控蛋白的应用，发明人：曾嵘, 阮宏强, 徐孟杰, 李辰, 武祎
  12. ZL200910056785.3 一种酸性核磷酸蛋白pp32的应用，发明人：曾嵘, 徐孟杰, 李辰, 武祎, 阮宏强.

主持或参加科研项目及人才计划项目

  1. 基于心血管疾病动物模型血管稳态维持与失衡的系统生物学研究，国家自然科学基金重大研究计划，2016-2018，参与
  2. 非可控性炎症恶性转化的调控网络及其分子机制，国家自然科学基金重大研究计划，2011-2014，参与
  3. 重建时变结构的基因调控网络的模型和算法及在糖尿病研究中的应用，国家自然科学基金面上项目，2011-2013，参与
  4. 细胞生长调控的重要蛋白质群的功能与作用机制研究，科技部973计划项目，2010-2014，参与
  5. 肝病发生发展中的蛋白质翻译后修饰及其调控的定量蛋白质组学研究，科技部973计划项目，2010-2014，参与
  6. Wnt信号转导途径/网络的动态研究，国家自然科学基金青年科学基金项目，2008-2010，主持
  7. 基于WHV/myc转基因模型小鼠肝癌发病机制的蛋白质动态研究，上海生科院优秀青年人才领域前沿项目，2007-2009，主持
  8. 干细胞表面分子特征与功能，科技部973计划项目，2007-2011，参与