丁琛

个人信息

北京蛋白质组研究中心，副研究员，主要个人荣誉：中组部“青年千人计划”（第五批）、北京市“海聚工程青年项目”（第九批）、Thermo Fisher全球科学联盟专家。

教育及工作经历

2003年-2008年 中国科学技术大学 理学博士

2009年-2012年 美国贝勒医学院 生物化学系 博士后

2012年至今 北京蛋白质组研究中心 网络与信号转导研究组 副研究员

科研方向

蛋白质组学平台建设，质谱新技术新方法开发，转录因子大规模鉴定及转录调控, 肝脏代谢信号转导研究

发表文章

  1. Foulds CE*, Feng Q*, Ding C*, Bailey S, Hunsaker TL, Malovannava A, Hamilton RA, Gates LA, Zhang Z, Li C, Chan D, Bajaj A, Callaway CG, Dean P. Edwards DP, Lonard DM, Tsai SY, Tsai MJ, Qin J, and Bert W. O'Malley BW, 'Proteomic Analysis of Coregulators Bound to ER on DNA and Nucleosomes Reveals Dynamic ‘Poised’ Complexes', Molecular Cell, 2013 Jul 25;51(2): 185-99. (*Co-first author)
  2. Ding C, Jiang J, Wei J, Liu W, Zhang W, Liu M, Fu T, Lu T, Song L, Ying W, Chang C, Zhang Y, Ma J, Wei L, Malovannaya A, Jia L, Zhen B, He F, Qian X, Qin J, 'A Fast Workflow for Identification and Quantification of Proteomes', Molecular & Cellular Proteomics, 2013 Aug;12(8): 2370-80.（所创技术平台已作为“人类蛋白质组计划”执行标准技术向全国推广）
  3. Ding C, Chan D, Liu W, Liu M, Li D, Li C, Jin J, Malovannaya A, Jung SY, Zhen B, Wang Y, Qin J, 'Proteome-wide profiling of activated transcription factors with a concatenated tandem array of transcription factor response elements', Proc Natl Acad Sci U S A, 2013 Apr 23; 110(17): 6771-6.（已申请中美专利，包括Thermo、GSK在内多家企业表示兴趣）
  4. Ding C, Li Y, Kim BJ, Malovannaya A, Jung SY, Wang Y, Qin J, 'Quantitative analysis of cohesin complex stoichiometry and SMC3 modification-dependent protein interactions', J Proteome Res, 2011 Aug 5; 10(8): 3652-9.
  5. Ding C, Wei H, Sun R, Zhang J, Tian Z, 'Hepatocytes Proteomic Alteration and seroproteome analysis of HBV Transgenic Mice', Proteomics, 2009 Jan; 9(1): 87-105.
  6. Liu Q, Ding C, Liu W, Song L, Liu M, Qi L, Fu T, Malovannaya A, Wang Y, Qin J, Zhen B, 'In-depth Proteomic Characterization of Endogenous Nuclear Receptors in Mouse Liver', Mol Cell Proteomics, 2013 Feb; 12(2): 473-84. doi: 10.1074/mcp.M112.022319. Epub 2012 Nov 29.
  7. Malovannaya A, Lanz RB, Jung SY, Bulynko Y, Le NT, Chan DW, Ding C, Shi Y, Yucer N, Krenciute G, Kim BJ, Li C, Chen R, Li W, Wang Y, O'Malley BW, Qin J, 'Analysis of the human endogenous coregulator complexome', Cell, 2011 May 27; 145(5): 787-99.
  8. Ma J, Li W, Lv Y, Chang C, Wu S, Song L, Ding C, Wei H, He F, Jiang Y, Zhu Y, 'A new insight into the impact of different proteases on SILAC quantitative proteome of the mouse liver', Proteomics, 2013 Aug; 13(15): 2238-42.
  9. Long W, Foulds CE, Qin J, Liu J, Ding C, Lonard DM, Solis LM, Wistuba II, Qin J, Tsai SY, Tsai MJ, O'Malley BW, 'ERK3 signals through SRC-3 coactivator to promote human lung cancer cell invasion', J Clin Invest, 2012 May 1; 122(5): 1869-80. doi: 10.1172/JCI61492. Epub 2012 Apr 16.
  10. Huang W, Dong Z, Wei H, Ding C, Sun R, Tian Z, 'Selective elimination of hepatic natural killer T cells with concanavalin A improves liver regeneration in mice', Liver Int, 2006 Apr; 26(3): 339-45.

获得专利

  1. 201110457108.X 一种富集分离内源转录因子及其复合物的方法及其专用转录因子串联结合序列
  2. 201110457671.7 一种富集分离内源核受体的方法及其专用DNA结合序列
  3. 201210210614.3 一种两维短梯度高效蛋白质组分离鉴定方法
  4. US 13730, 177 A method for enrichment and isolation of endogenous transcription factor and complexes thereof and Corresponding tandem arrays of concatenated transcription factor response elements

作为负责人获得基金资助

  1. 蛋白质功能网络与定量分析的关键技术研究与开发，863课题子课题，2012年-2015年
  2. II型糖尿病脂滴蛋白防诊治靶点筛选与验证，科技部国际合作课题，2012年-2015年
  3. 肝脏再生中转录因子动态变化的研究，国家自然科学基金青年项目，2013年-2015年
  4. 非酒精性脂肪肝中脂相关蛋白质组学研究，北京市自然科学基金面上项目，2013年-2015年
  5. 蛋白质组定量与疾病标志物筛选验证技术和标准肽段数据库与实物库，北京市留学人员科技活动择优资助，重点项目
  6. Transcription factor (TF) DNA binding activity profiling in tumor tissues, Thermo Fisher Scientific Global Science Alliance Project 2014-2015