个人简介

邵晨，博士，助理研究员，研究方向为蛋白质组学和蛋白质相互作用的生物信息学。2004年毕业于北京大学数学科学学院数学与应用数学专业，获学士学位。同年进入中国医学科学院基础医学研究所攻读研究生，导师为高友鹤教授，2009年博士毕业后留所工作。曾获得在旧金山举行的美国生物化学分子生物学学会2006年度年会的旅行奖（American Society for Biochemistry and Molecular Biology Graduate/Postdoctral Travel Award），以及2008年中国医学科学院优秀研究生

主要研究工作

1. 应用神经网络等机器学习方法，进行蛋白质相互作用预测。建立的预测系统可以有效地预测一些蛋白质结构域结合的配体蛋白，提高了发现新相互作用的效率。

2. 蛋白质组鉴定生物信息学分析新算法的建立。提出了一个新的计算串联质谱谱图与多肽匹配概率的参数Oscore，提高了蛋白质鉴定的准确度，并参与了通过建立色谱保留时间数据库，辅助蛋白质鉴定的工作。

3. 蛋白质组学数据分析。参与了应用黑箱的方法，比较肾脏输入蛋白质组（血浆）和输出蛋白质组（尿），系统研究肾脏蛋白处理功能的工作。

主要论著目录

1、 Chen Shao, Wei Sun, Fuxin Li, Ruifeng Yang, Ling Zhang and Youhe Gao （2009）Oscore: a combined score to reduce false negative rate for peptide identification in tandem mass spectrometry analysis  Journal of Mass Spectrometry 44(1):25-31

2、 Ling Zhang*, Chen Shao*, Dexian Zheng and Youhe Gao （2006）An integrated machine learning system to computationally screen protein databases for Protein binding peptide ligands. Molecular & Cellular Proteomics 5: 1224-1232.（contributed equally）

3、 Lulu Jia, Ling Zhang, Chen Shao, Eli Song , Wei Sun, Mingxi Li  and Youhe Gao. (2009) An attempt to understand kidney’s protein handling function by comparing plasma and urine proteomes. Plos One 4（4）：e5146

4、 Wei Sun, Ruifeng Yang, Ling Zhang, Chen Shao, Zhengguo Zhang and Youhe Gao （2009） Improve peptide identification by empirical peptide retention time database Rapid Communication in Mass Spectrometry 23（1）：109－118